נשיאי סלובניה נבחרים בבחירות ישירות על-ידי כלל האזרחים לתקופת כהונה של חמש שנים. נשיא אינו רשאי לכהן יותר משתי תקופות כהונה רצופות. הנשיאים נבחרים בשיטת רוב בשני סיבובים (majority-runoff): אם אף מועמד לא זוכה ברוב של הקולות (מעל 50%) מתקיים כעבור שלושה שבועות סיבוב שני בו מתמודדים שני המועמדים המובילים. בבחירות האחרונות התמודדו 9 מועמדים. הנשיא נבחר בסיבוב השני.