בנייר העמדה 'יחידות המסתערבים' יבקש צוות המכון לבחון את חוקיותן של היחידות (המיוחדות) המוסוות המופעלות בצבאות מספר, בהם של ישראל, על פי אמות המידה של המשפט הבין-לאומי. יחידות אלו, שזכו בצה"ל לכינוי 'מסתערבים', נוהגות להשתמש בתחפושות כדי להיטמע באוכלוסייה האזרחית לשם לכידת מבוקשים וחיסולם, פיזור הפרות סדר ועוד.
אופן פעילותן של היחידות, כאשר לוחמיהן אינם לבושים מדים, מעורר שאלות רבות ביחס לעקרונות יסוד של המשפט הבין-לאומי ההומניטרי (הדין הנועד להסדיר סכסוך חמוש), ובהם עקרון ההבחנה, המחייב לוחמים להבחין את עצמם מאוכלוסייה אזרחית, שממנו נגזרת החובה על לבישת סימן היכר, ועולה השאלה – על מי היא חלה? ועקרון המידתיות, האוסר פעולה צבאית העלולה לגרור פגיעה באינטרסים הומניטריים כאשר הפעולה אינה מידתית בבחינת התועלת שתופק מן הפעולה הצבאית. שאלה מקדמית לדיון תהיה סוגיית תחולתם של הדינים, המוסדרים בשלושה מקורות משפטיים, על הסכסוך הישראלי–פלסטיני, בהיותו סכסוך בעל אופי שאינו בין-לאומי. כן ייבחן אופי הפעילות, האם להגדירה פעולת שיטור או לחימה?