ספרים
ידידה צ' שטרן ושוקי פרידמן (עורכים). 2011, רבנות: האתגר, ירושלים: עם עובד והמכון הישראלי לדמוקרטיה.
דידיה צ' שטרן, (עורך), 2010. צדק שלי, צדק שלך - צדק בין תרבויות, ירושלים: מרכז שז"ר והמכון הישראלי לדמוקרטיה.
יצחק ברנד וידידיה צ' שטרן (מנחה), 2010. ערכאות של גויים במדית היהודים, ירושלים: המכון הישראלי לדמוקרטיה.
ידידיה צ' שטרן, 2010. מיעוטים במדינה יהודית: היבטים הלכתיים, ירושלים: המכון הישראלי לדמוקרטיה.
ידידיה צ' שטרן, 2009. ספרות השו"ת: הגיור בראי הדורות, תל אביב: הוצאת ידיעות ספרים.
ידידיה צ' שטרן, 2008. תכלית החברה העסקית, ירושלים: המכון הישראלי לדמוקרטיה.
ידידיה צ' שטרן, 2008. הבעלות בחברה העסקית - תאוריה, דין, מציאות, ירושלים: המכון הישראלי לדמוקרטיה.
ידידיה צ' שטרן ואבי שגיא, (עורכים) 2008. הרצל אז והיום: 'מדינת היהודים' במדינת היהודים ירושלים: מכון שלום הרטמן ואוניברסיטת בר-אילן.
ידידיה צ' שטרן ואביעזר רביצקי, 2007. דברים ושברי דברים: על יהדותה של מדינה דמוקרטית, ירושלים: המכון הישראלי לדמוקרטיה.
ידידיה צ' שטרן, 2006. מדינה, משפט והלכה ד. מה יהודי במשפט הישראלי, ירושלים: המכון הישראלי לדמוקרטיה.
ידידיה צ' שטרן, 2004. מדינה, משפט והלכה ג. דת ומדינה: תפקידה של ההלכה, ירושלים: המכון הישראלי לדמוקרטיה.
ידידיה צ' שטרן ויפה זילברשץ, 2003. המשפט בישראל: מבט לעתיד, רמת גן: אוניברסיטת בר אילן.
ידידה צ' שטרן, 2002. מדינה, משפט והלכה ב. עושר שמור לבעליו לרעתו: מקומם של המשפט ושל ההלכה בחברה הישראלית, ירושלים: המכון הישראלי לדמוקרטיה.
ידידיה צ' שטרן, 2000. מדינה, משפט והלכה א. מנהיגות ציבורית כסמכות הלכתית, ירושלים: המכון הישראלי לדמוקרטיה.
ידידה צ' שטרן, 1999. פסיקת הלכה בשאלות מדיניות, ירושלים: המכון הישראלי לדמוקרטיה.
ידידיה צ' שטרן, אבי שגיא ודודי שוורץ, 1999. יהדות פנים וחוץ: דיאלוג בין עולמות, ירושלים: מאגנס.
ידידיה צ' שטרן, 1996. רכישת חברות, ירושלים: מכון הארי סאקר, הפקולטה למשפטים באוניברסיטה העברית.
Yedidia Z. Stern and Avi Sagi, Barefoot Homeland. Am-Oved and The Israel Democracy Institute (2011)
Yedidia Z. Stern and Shuki Friedman, Rabbis and Rabbinate: The Challenge – 2 vol. Am-Oved and The Israel Democracy Institute(2011)
Yedidia Z. Stern, My Justice, Your Justice: Justice across Cultures. Zalman Shazar Center and TheIsrael Democracy Institute (2010)
Yedidia Z. Stern, Corporate Goal. The Israel Democracy Institute, Bar-Ilan University Press, and the Israeli Bar-Publishing House. Jerusalem (2009)
Yedidia Z. Stern, The Jewish Responsa: Conversion in Jewish History. Yedioth Sefarim (2008)
Yedidia Z. Stern, The Ownership of a Corporation: Theory, Law, Reality. The Israel Democracy Institute, Bar-Ilan University Press, and the Israeli Bar-Publishing House. Jerusalem (2008)
Yedidia Z. Stern and Aviezer Ravitzky, The Jewishness of Israel The Israel Democracy Institute, Jerusalem (2007)
ספרים בהכנה:
ידידיה צ' שטרן ובני פורת. אדם לאדם – אח ורֵע (לחצו כאן לטיוטה המקוונת).
ידידיה צ' שטרן וקלמן נוימן. דת פוגשת מדינה: הסיפור הציוני-דתי (לחצו כאן לטיוטה המקוונת).
מאמרים
שטרן פרסם מעל 40 מאמרים מקצועיים בספרים ובכתבי עת מדעיים בארץ ובחו"ל.